Il nostro approccio
Per portare terapie mirate alla TBXT ai pazienti affetti da cordoma, la Chordoma Foundation sta lavorando attivamente per rendere possibile, ridurre i rischi e accelerare ogni fase del processo di scoperta e sviluppo di terapie mediche con la TBXT:
il finanziamento della ricerca di base sulla funzione TBXT
lo sviluppo di risorse, strumenti e set di dati condivisi per la ricerca
l'offerta di una serie di capacità di biologia di scoperta e di ricerca traslazionale attraverso i Chordoma Foundation Labs
Collaborando con aziende e ricercatori per consentire uno sviluppo efficiente dei farmaci.
Lavorare insieme
Sfruttando le nostre capacità di laboratorio, ci proponiamo di collaborare con aziende e ricercatori per far progredire le molecole mirate al TBXT in tutte le fasi di sviluppo.
Il nostro supporto è personalizzato per soddisfare le esigenze specifiche di ogni programma.
Vi invitiamo a mettervi in contatto con il nostro team per valutare come possiamo integrare le vostre competenze e i vostri interessi specifici per la droga TBXT.
Identificazione e validazione degli hit
Forniamo l'accesso a saggi di screening ad alto rendimento per identificare le molecole mirate alla TBXT e valutarne il potenziale. Il nostro obiettivo è quello di abbassare la barriera d'ingresso al bersaglio della TBXT e di consentire una rapida decisione di procedere o meno.
Ottimizzazione hit-to-lead
Siamo in grado di supportare cicli iterativi di saggi/progettazione per facilitare l'ulteriore ottimizzazione di composti mirati alla TBXT verso l'identificazione di candidati leader.
Ottimizzazione dei lead e non solo
Siamo interessati a stringere collaborazioni per far progredire i candidati attraverso l'ottimizzazione della pista, lo sviluppo preclinico e, infine, la presentazione dell'IND e lo sviluppo clinico.
Risorse disponibili
Proteina TBXT purificata
TBXT ricombinante (proteina completa o dominio isolato di legame al DNA) espressa in E.coli e purificata mediante cromatografia di affinità e di esclusione dimensionale.
TBXT a lunghezza intera (C-terminale AviTag)
Dominio legante il DNA (in arrivo)
Saggi di proliferazione cellulare
Saggio di proliferazione CellTiter-Glo(link al protocollo)
I nostri partner del Consorzio di Genomica Strutturale (SGC) hanno prodotto i seguenti set di dati ad accesso libero rilevanti per la scoperta di farmaci TBXT:
TBXT SGC TEP
Dominio di legame del DNA di TBXT (struttura cristallina legata al DNA)
Modelli preclinici di cordoma
Abbiamo raccolto una collezione di linee cellulari di cordoma, modelli CDX e PDX convalidati e ben caratterizzati, disponibili nei nostri archivi. Per saperne di più , cliccare qui.
Capacità disponibili
Linee cellulari ingegnerizzate
- Abbiamo ingegnerizzato il cordoma e altre linee cellulari tumorali TBXT-positive per esprimere un shRNA TBXT inducibile con la doxiciclina. L'abbattimento di TBXT inducibile è stato convalidato mediante Western blot, immunofluorescenza e/o RT-PCR. Queste linee esprimono anche costitutivamente la GFP. Le seguenti linee cellulari ingegnerizzate sono disponibili grazie alla collaborazione con CF Labs:
- U-CH1 (cordoma) TBXT shRNA
- H460 (NSCLC) TBXT shRNA
- SW480 (colorettale) TBXT shRNA
Saggi di legame e strutturali
Risonanza plasmonica di superficie (SPR): Utilizziamo un sistema SPR Biacore 8K per scoprire i ligandi di TBXT. La TBXT purificata e biotinilata viene immobilizzata su un chip sensore rivestito di streptavidina e il legame dei composti alla TBXT viene valutato in base all'affinità allo stato stazionario. Per saperne di più sul nostro protocollo , cliccate qui.
NMR biomolecolare (prossimamente)
Cristallografia (prossimamente)
Bioinformatica strutturale (prossimamente)
Saggio reporter TBXT
Per determinare se i composti inibiscono funzionalmente la TBXT, abbiamo ingegnerizzato le cellule H460 per esprimere GFP a valle di un elemento di risposta della TBXT. Possiamo valutare l'inibizione di TBXT con un elevato throughput monitorando i livelli di GFP con un lettore di piastre a fluorescenza.
Saggi funzionali
Saggio di reporter genico per valutare l'inibizione dell'attività trascrizionale di TBXT.
qRT-PCR per misurare l'espressione dei geni bersaglio di TBXT, tra cui TBXT, YAP1 e KRT8.
Studi di efficacia su xenotrapianti
Studi sul meccanismo d'azione
Inibizione del legame con il DNA (saggio di spostamento della mobilità elettroforetica/protocollo di saggio di spostamento del gel del DNA)
Saggio di degradazione e salvataggio del TBXT
Perché TBXT?
L'espressione di TBXT è un segno distintivo quasi universale del cordoma. Questo fattore di trascrizione è un regolatore essenziale dello sviluppo della notocorda embrionale e un numero crescente di prove suggerisce che sia un regolatore principale del cordoma e che sia necessario per la crescita del tumore. In particolare, studi di genomica funzionale hanno identificato TBXT come un elemento genetico essenziale nelle cellule di cordoma. Sembra inoltre che sia espresso in minima parte nei tessuti adulti sani, il che lo rende un bersaglio terapeutico interessante.
Oltre al cordoma, la TBXT è stata associata alla progressione del tumore, alla resistenza alle terapie e ai risultati negativi per i pazienti in molti altri tipi di cancro, tra cui polmone, colon, seno e prostata.
Ciò sottolinea il valore potenziale di TBXT come bersaglio farmacologico con una rilevanza che va ben oltre il cordoma.
(Foto: Dimitrios, paziente affetto da cordoma, visita i Chordoma Foundation Labs con suo padre, Theodore).
Ulteriori informazioni sul ruolo di TBXT nel cordoma e in altri tumori solidi
Impegnatevi con noi
Se siete un 'azienda o un ricercatore interessato a esplorare la TBXT come bersaglio terapeutico, vi invitiamo a contattarci per saperne di più su come possiamo sostenere i vostri sforzi.
Se invece siete finanziatori o donatori il cui obiettivo è quello di avere un impatto significativo nella lotta contro il cordoma e altri tumori associati alla TBXT, come quelli del polmone, del colon, della mammella e della prostata, vi invitiamo a considerare un contributo a questo lavoro.