U-CH1

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Caratteristiche generali

Età: 56 anni
Sesso: Maschio
Origine della malattia: Sacrale
Stato della malattia: Recidiva
Radiazione precedente: Sì
Terapia sistemica precedente: No
Fonte: Silke Bruderlein, Peter Moller
Università di Ulm

Caratteristiche molecolari

Morfologia cellulare: Fisiofila
Espressione di TBXT: Positiva; 10 volte quella di U-CH2 con sovraespressione ma senza amplificazione
Localizzazione di TBXT: Nucleare
Espressione di CD24: Positiva; 13 volte quella di U-CH2
Tipo HLA: A2
Dati di sequenza:

Dati WGS, Exome e Transcriptome disponibili: dati di sequenziamento grezzi in Cavatica (Chordoma Foundation Dataset) e dati di sintesi in PedcBioPortal. Contattare researchteam@chordoma.org per qualsiasi domanda.
Stato di SMARCB1: Wild-type
Risultati della convalida: Rapporto di validazione

Condizioni di crescita

Terreno di crescita: IMDM: RPMI-1640 (4:1) +10% FBS
Terreno di congelamento: 70% di terreno di crescita completo integrato con un ulteriore 20% di siero fetale bovino e 10% di DMSO.
Condizioni di coltura: Temperatura: 37°C
Atmosfera: aria, 95%; anidride carbonica (CO2), 5%.
Istruzioni per la subcoltura: Procedure di coltura cellulare

Pubblicazioni

Caratterizzato da:
  • Scheil S, Brüderlein S, Liehr T, Starke H, Herms J et al. (2001) Analisi genomica di sedici cordomi mediante ibridazione genomica comparativa e citogenetica della prima linea cellulare di cordoma umano, U-CH1. Genes Chromosomes Cancer 32: 203-211. PubMed: 11579460.

Ulteriori riferimenti:

  • Scheipl S, Lohberger B, Rinner B, Froehlich EV, Beham A et al. (2013) Histone deacetylase inhibitors as potential therapeutic approaches for cordoma: an immunohistochemical and functional analysis. J Orthop Res 31(12):1999-2005. PubMed: 23893747.
  • Brüderlein S, Sommer J, Meltzer P, Li S, Osada T et al. (2010) Molecular Characterization of Putative Chordoma Cell Lines. Sarcoma: 630129. PubMed: 21253487.
  • Duan Z, Shen J, Yang X, Yang P, Osaka E et al. (2014) Significato prognostico dell'espressione del miRNA-1 (miR-1) nei pazienti con cordoma. J Orthop Res. PubMed: 24501096.
  • Shalaby A, Presneau N, Ye H, Halai D, Berisha F, Idowu B et al. (2011) The role of epidermal growth factor receptor in chordoma pathogenesis: a potential therapeutic target. J Pathol 223(3):336-46. PubMed: 21171079.
  • Scheil-Bertram S, Kappler R, von Baer A, Hartwig E, Sarkar M et al. Profilazione molecolare del cordoma. Int J Oncol 44(4):1041-55. PubMed: 24452533.
  • Xia M, Huang R, Sakamuru S, Alcorta D, Cho MH et al. (2013) Identificazione di piccoli farmaci molecolari riproposti per la terapia del cordoma. Cancer Biol Ther 14(7):638-47. PubMed: 23792643.
  • Duan Z, Choy E, Nielsen GP, Rosenberg A, Iafrate J et al. (2010) Differential expression of microRNA (miRNA) in cordoma reveals a role for miRNA-1 in Met expression. J Orthop Res 28(6):746-52. PubMed: 20041488.
  • Yang C, Hornicek F, Wood KB, Schwab JH, Choy E et al. (2010) Caratterizzazione e analisi di linee cellulari di cordoma umano. Colonna vertebrale 35(13):1257-64. PubMed: 20461036.
  • Presneau N, Shalaby A, Ye H, Pillay N, Halai D, Idowu B et al. (2011) Ruolo del fattore di trascrizione T (brachyury) nella patogenesi del cordoma sporadico: uno studio genetico e funzionale. J Pathol 223(3):327-35. PubMed: 21171078.